产几丁质脱乙酰酶海洋细菌的筛选鉴定及产酶条件优化

柴金龙1,王敏卜1,杭加豪1,张春光1,陈 丽2,焦豫良1,李宜泳3,房耀维1,2,刘 姝1,2*

(1.江苏海洋大学 海洋生命与水产学院,江苏 连云港 222005;2.江苏省海洋资源开发研究院,江苏 连云港 222000;3.江苏海洋大学 海洋资源与环境学院,江苏 连云港 222005)

摘 要:从海洋样品中筛选产几丁质脱乙酰酶的细菌,对高产菌株进行鉴定,并利用响应面法优化其发酵条件。结果表明,利用添加硝基乙酰苯胺的平板,根据黄色变色圈从海州湾海域海泥样品中筛选获得一株产几丁质脱乙酰酶的细菌MCDA3-3。通过形态学、生理生化特征以及16S rDNA序列分析,将该菌株鉴定为海洋硝酸盐还原菌(Nitratireductor aquimarinus)。利用单因素和响应面法优化菌株MCDA3-3发酵产酶培养基和培养条件,获得最佳发酵培养基配方为木薯淀粉1.1%,玉米浆1.0%,FeCl3·6H2O 0.045%,陈海水配制,pH 5.7;最佳发酵条件为接种量4%,30 ℃、180 r/min发酵48 h。在此条件下酶活为4.07 U/mL,是优化前的2.3倍。

关键词:几丁质脱乙酰酶;海洋细菌;响应面法;发酵条件优化

几丁质(Chitin)又称甲壳质、甲壳素,是由N-乙酰-D-葡萄糖胺(GlcNAc)以β-1,4糖苷键连接而成的天然高分子多糖,广泛存在于无脊椎动物的外骨骼,其含量仅次于纤维素[1-2]。由于几丁质中存在牢固的氢键使其性质相对稳定,不溶于水和大部分有机溶剂,难以应用。壳聚糖(chitosan)是几丁质通过脱除乙酰基后的产物,具有更好的溶解性和生物相容性,在食品、医药、轻工、印染、环保和农业等领域具有很大的开发和应用潜力[3-4]。目前,壳聚糖的生产主要采用化学方法,此法易造成环境污染问题。酶法生产壳聚糖绿色环保,且反应条件温和,能耗值相对较低,并可获得脱乙酰程度均一稳定的产品。因此,运用几丁质脱乙酰酶(chitin deacetylase,CDA)生产壳聚糖成为研究热点[5]

目前,真菌、细菌、昆虫、病毒和原生动物都有产CDA的报道。其中报道最多的是卷枝毛霉(Mucor circinelloides)、构巢曲霉(Aspergillus nidulans)及菜豆炭疽病菌(Colletotrichum lindemuthianum)等真菌CDA[6]。真菌CDA存在产酶活力低、难以催化晶体几丁质和催化温度较高的问题。细菌产CDA的报道较少,且报道的细菌多产几丁质寡糖脱乙酰酶(chitin oligosaccharide deacetylases,COD),只能水解寡聚几丁质脱乙酰基。海洋微生物丰富多样,可分泌催化性质独特的新颖酶类。本研究从海洋样品中筛选产CDA细菌,对菌株进行鉴定和培养条件优化研究,提高发酵产酶水平,为壳聚糖的酶法制备奠定基础。

1 材料与方法

1.1 材料与试剂

1.1.1 样品来源

海泥样品:采集于海州湾海域,置于含冰袋泡沫箱立即带回实验室进行菌株筛选。

1.1.2 试剂及培养基

几丁质:江苏澳新生物工程有限公司;其他生化试剂:上海博微生物科技有限公司;细菌基因组脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)快速提取试剂盒:杭州宝赛生物科技有限公司;引物合成:南京思普金生物公司。

富集培养基:壳聚糖0.25%,K2HPO40.07%,KH2PO40.03%,MgSO40.05%,NaCl 0.01%,蒸馏水配制,pH 7.2~7.5。

产几丁质脱乙酰酶筛选培养基:粉末几丁质0.2%,K2HPO40.07%,KH2PO40.03%,MgSO40.05%,对硝基-N-乙酰苯胺0.02%,琼脂2.0%,陈海水配制,pH 7.0。

LB纯化培养基:蛋白胨1.0%,NaCl 1.0%,酵母粉0.5%,琼脂2.0%,陈海水配制,pH 7.0~8.0。

种子培养基:蛋白胨1.0%,酵母粉0.5%,陈海水配制,pH 7.0。

发酵培养基:蛋白胨1.0%,葡萄糖1.0%,MgSO40.05%,陈海水配制,pH 7.0。

1.2 仪器与设备

SW-CJ-1D单人单面超净工作台:苏州净化设备有限公司;JXN-26 高速冷冻离心机:美国贝克曼库尔特有限公司;Q5000微量紫外分光光度计:上海在途生物科技有限公司;Mastercycler nexus聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)仪:德国Eppendorf有限公司;Nikon 90i全电动显微镜:上海普赫光电科技有限公司。

1.3 实验方法

1.3.1 产几丁质脱乙酰酶菌株的筛选

称取1 g样品于50 mL富集培养基,30 ℃、180 r/min培养3 d。取1 mL富集后的样液梯度稀释至10-6,选择10-4、10-5、10-6浓度的稀释液0.2 mL涂布于产几丁质脱乙酰酶筛选平板,30℃倒置培养2~7d,观察菌落生长及变色圈产生情况。挑选产生黄色变色圈的菌株接种至LB培养基纯化至单菌落后,斜面保藏。菌株接种至种子培养基培养24 h,再以1%(V/V)接种量接种至发酵培养基,30 ℃、180 r/min培养48 h。发酵液4 ℃、12 000×g离心10 min后测定几丁质脱乙酰酶酶活。

1.3.2 菌株MCDA3-3的鉴定

选取变色圈最大的菌株,命名为MCDA3-3,根据伯杰氏细菌鉴定手册对菌株MCDA3-3进行形态观察和生理生化鉴定[7]

1.3.3 菌株MCDA3-3的16S rDNA扩增及分析

用细菌DNA快速提取试剂盒提取MCDA3-3的基因组,进行16S rDNA扩增。PCR的通用引物:27F:5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3';1 492R:5'-GGTTACCTTGT TACGACTT-3'。反应体系为50 μL:Premix 25 μL,ddH2O 22 μL,上下游引物各1 μL,DNA模板1 μL。反应程序:94 ℃预变性5 min;94 ℃变性30 s,54 ℃退火30 s,72 ℃延伸90 s,35个循环;72 ℃终延伸5 min。PCR扩增产物送至南京思普金公司测序,所得序列提交GenBank。将该序列与GenBank数据库中的序列进行同源性比对,用MEGA 7.0软件进行16S rDNA序列的比对分析,并构建系统发育树。

1.3.4 培养基成分对菌株MCDA3-3发酵产酶的影响

发酵条件:以1%接种量将种子液接种到发酵培养基中,发酵培养基初始pH 7.0、装液量为50 mL/250 mL,在30 ℃、180r/min条件下培养72h,进行几丁质脱乙酰酶的酶活测定。

碳源的确定:分别添加1.0%的葡萄糖、麦芽糖、蔗糖、乳糖、豌豆淀粉、玉米淀粉、马铃薯淀粉、木薯淀粉。

氮源的确定:分别添加1.0%的蛋白胨、尿素、牛肉膏、豆粕、玉米浆(干粉)、米糠、花生粕、麸皮、NH4NO3、NH4Cl、(NH42SO4

无机盐的确定:分别添加0.05%的MgSO4、CuSO4、CaCl2、NaH2PO4、KH2PO4、MnSO4、ZnSO4、BaCl2、FeCl3

初始pH值的确定:改变培养基初始pH分别为4.0、5.0、6.0、7.0、8.0、9.0、10.0。

1.3.5 发酵条件对菌株MCDA3-3产酶的影响

基本条件:以1%接种量将种子液接种到发酵培养基中,发酵培养基初始pH 7.0、装液量为50 mL/250 mL,在30 ℃、180 r/min条件下培养72 h,根据以下方法设置培养条件,并进行几丁质脱乙酰酶的酶活测定。发酵温度15 ℃、20 ℃、25 ℃、30 ℃、35 ℃、40 ℃;发酵时间24 h、36 h、48 h、60 h、72 h、84 h、96 h;接种量0.5%、1%、2%、3%、4%、5%;转速100r/min、120r/min、140r/min、160r/min、180r/min、200r/min。

1.3.6 响应面法优化菌株MCDA3-3产酶条件

根据单因素结果,选择对发酵产酶影响最显著的木薯淀粉、FeCl3·6H2O及初始pH值3个因素为变量,酶活大小为响应值,运用Design Expert 11设计3因素3水平共17个试验点的Box-Behnken响应面分析试验。根据响应面分析的结果,配制最佳培养基做验证试验。

1.3.7 几丁质脱乙酰酶酶活力的测定

试管中加入30 ℃预保温的0.05 mol/L pH 7.0磷酸缓冲液3mL,200mol/L的对硝基乙酰苯胺水溶液1 mL,酶液1 mL,于30 ℃水浴反应15 min,沸水浴终止酶促反应,8 000×g离心10 min,测定上清液的吸光度值。以添加1 mL同样浓度沸水浴灭活15 min的酶液作为对照。酶活单位(U)定义:在上述反应条件下每小时产生1 μg对硝基苯胺所需要的酶量定义为一个酶活力单位。相对酶活(%)定义:以组内最高酶活为1,其他酶活与最高酶活的百分比即为相对酶活。

1.3.8 数据处理与分析

每组试验设3组平行,重复试验3次,试验结果用平均值±标准方差(n=3)表示,采用Origin 2018作图,响应面采用Design Expert 11进行统计分析。

2 结果与分析

2.1 产几丁质脱乙酰酶菌株的筛选

将富集培养的土样涂布于产几丁质脱乙酰酶的筛选培养基,挑取产黄色变色圈明显的菌株共5株,变色圈最大的菌株为MCDA3-3。挑取单菌落至种子培养基,以1%接种量接种至发酵培养基30 ℃、180 r/min培养72 h后,4 ℃、12 000×g离心10 min,测定发酵上清中几丁质脱乙酰酶的酶活为1.74 U/mL。

2.2 菌株MCDA3-3的鉴定

2.2.1 菌株MCDA3-3的形态学特征

菌株MCDA3-3的形态学观察见图1。由图1可知,菌株MCDA3-3为革兰氏阴性短杆菌,无芽孢。在LB培养基上25 ℃生长3 d,菌落呈圆形,灰褐色半透明,表面湿润,边缘规则,无晕环,中央突起,直径0.1~0.5 mm,易挑取。

图2 菌株MCDA3-3的形态观察结果
Fig.2 Morphological observation results of strain MCDA3-3

注:a:菌株MCDA3-3革兰氏染色结果;b:菌株MCDA3-3菌落形态。

2.2.2 菌株MCDA3-3的生理生化特征

菌株MCDA3-3部分生理生化试验结果见表1。结果表明,明胶液化试验、H2O2试验、反硝化、果糖试验均呈阳性,吲哚试验、三梨醇、甘露醇、麦芽糖、蔗糖、柠檬酸盐试验均为阴性。

表1 菌株MCDA3-3的生理生化试验结果
Table 1 Physiological and biochemical tests results of strain MCDA3-3

注:“+”表示反应呈阳性;“-”表示反应呈阴性。

2.2.3 菌株MCDA3-3的16S rDNA扩增及分析

将PCR产物送至南京思普金公司测序,所得1 335 bp序列提交GenBank(登录号:MH988743)。将该序列与GenBank数据库中的序列进行同源性比对,发现与菌株Nitratireductor aquimarinus(登录号:HQ176466.1)16S rDNA相似性最高,达到100%。用MEGA 7.0软件进行16S rDNA序列的比对分析,并构建系统发育树,菌株MCDA3-3与Nitratireductor aquimarinus亲缘关系最近(见图2),因此将菌株MCDA3-3鉴定为海洋硝酸盐还原菌(Nitratireductor aquimarinus)。

图2 基于16S rDNA序列菌株MCDA3-3的系统发育树
Fig.2 Phylogenetic tree of strain MCDA3-3 based on 16S rDNA sequence

2.3 培养基成分对菌株MCDA3-3产酶的影响

2.3.1 碳源对菌株MCDA3-3产酶的影响

碳源对菌株MCDA3-3产酶的影响如图3所示。碳源为木薯淀粉时相对酶活最高,最高酶活为2.85 U/mL,麦芽糖和葡萄糖的相对酶活也达到75%以上,而豌豆淀粉和玉米淀粉相对酶活较低,因此碳源确定为木薯淀粉。

图3 碳源对菌株MCDA3-3产酶的影响
Fig.3 Effect of carbon source on enzyme production by strain MCDA3-3

2.3.2 氮源对菌株MCDA3-3产酶的影响

氮源对菌株MCDA3-3产酶的影响如图4所示。氮源为豆粕和玉米浆时相对酶活都达到90%以上,其中豆粕最高,最高酶活为2.57 U/mL,而麸皮和米糠的相对酶活仅为30%左右,考虑到豆粕的成本高,因此氮源确定为玉米浆。

图4 氮源对菌株MCDA3-3发酵产酶的影响
Fig.4 Effect of nitrogen source on enzyme production by strain MCDA3-3

2.3.3 无机盐对菌株MCDA3-3产酶的影响

无机盐对菌株MCDA3-3产酶的影响如图5所示,无机盐为FeCl3时相对酶活最高,最高酶活为2.07 U/mL,其次是BaCl2、KH2PO4,而CuSO4、ZnSO4、CaCl2、MnSO4的相对酶活都低于30%,因此无机盐确定为FeCl3·6H2O。

图5 无机盐对菌株MCDA3-3发酵产酶的影响
Fig.5 Effect of inorganic salts on enzyme production by strain MCDA3-3

2.3.4 培养基初始pH值对菌株MCDA3-3产酶的影响

图6 培养基初始pH值对菌株MCDA3-3产酶的影响
Fig.6 Effect of initial pH of medium on enzyme production by strain MCDA3-3

培养基初始pH对菌株MCDA3-3产酶的影响如图6所示,随着初始pH增大,相对酶活先上升后下降,pH较高时会使酶蛋白变性失活,pH 6.0相对酶活最高,最高酶活为2.74 U/mL,初始pH在5.0~9.0之间相对酶活都较高,达到60%以上,因此培养基初始pH确定为6.0。

2.4 发酵条件对菌株MCDA3-3产酶的影响

2.4.1 发酵时间对菌株MCDA3-3产酶的影响

发酵时间对菌株MCDA3-3产酶的影响如图7所示,随着发酵时间延长,培养基中的营养物质逐渐被消耗,相对酶活先上升后下降,在48 h时相对酶活最高,最高酶活为2.35 U/mL,因此发酵时间确定为48 h。

图7 发酵时间对菌株MCDA3-3产酶的影响
Fig.7 Effect of fermentation time on enzyme production by strain MCDA3-3

2.4.2 发酵温度对菌株MCDA3-3产酶的影响

发酵温度对菌株MCDA3-3产酶的影响如图8所示,随着发酵温度的升高,相对酶活先上升后下降,温度高时会使酶蛋白变性失活,30 ℃达到最大值,最高酶活为2.76 U/mL,温度在15~40 ℃之间相对酶活都较高,达到60%以上,因此发酵温度确定为30 ℃。

图8 发酵温度对菌株MCDA3-3产酶的影响
Fig.8 Effects of fermentation temperature on enzyme production by strain MCDA3-3

2.4.3 接种量对菌株MCDA3-3产酶的影响

接种量对菌株MCDA3-3产酶的影响如图9所示,随着接种量的增加,相对酶活先上升后下降,接种量高菌株生长迅速,营养物质消耗也随之加快,接种量为4%时相对酶活最高,最高酶活为2.64 U/mL,因此接种量确定为4%。

图9 接种量对菌株MCDA3-3产酶的影响
Fig.9 Effect of inoculum on enzyme production by strain MCDA3-3

2.4.4 转速对菌株MCDA3-3产酶的影响

转速对菌株MCDA3-3产酶的影响如图10所示,随着转速增加,相对酶活先上升后下降,转速高菌株生长迅速,培养基营养物质消耗也加快,转速为180 r/min时相对酶活最高,最高酶活为2.92 U/mL,因此转速确定为180 r/min。

图10 转速对菌株MCDA3-3产酶的影响
Fig.10 Effect of rotating speed on enzyme production by strain MCDA3-3

2.5 响应面法优化菌株MCDA3-3产CDA的发酵条件

在单因素试验的基础上,选择碳源(木薯淀粉)、无机盐(FeCl3·6H2O)、初始pH值3个因素为变量,以酶活大小为响应值,运用Design Expert 11设计3因素3水平共17个试验点的Box-Behnken响应面分析试验(表2)。对试验数据进行回归分析,得二次多项式方程:

由表3可知,从F值的大小可以得到,一次项中各因素对几丁质脱乙酰酶酶活的影响顺序是ACB。对几丁质脱乙酰酶酶活的方差分析可得模型P<0.01,表明该方程模型极显著,不同处理间的差异性极显著;失拟项P>0.05,表明模型失拟项不显著;模型的R2为0.965 4,说明该模型能解释96.54%响应值的变化,因而该模型拟合程度良好,试验误差小,可以用于预测最优发酵条件参数。

表2 Box-Behnken试验设计及结果
Table 2 Design and results of Box-Behnken tests

表3 回归模型方差分析
Table 3 Variance analysis of regression model

注:“-”为对结果影响不显著(P>0.05);“*”为对结果影响显著(P<0.05);“**”为对结果影响极显著(P<0.01)。

根据响应面三维图结果(图11)显示,响应面开口朝下,响应值随各自变量的值先增加后减少,说明此模型有突出稳定点,且稳定点是该模型的最大值。具体体现:初始pH值固定为6.0时,当FeCl3·6H2O添加量在0.043%~0.053%,木薯淀粉添加量在0.96%~1.11%区间内酶活显示最大值;FeCl3·6H2O添加量为0.05%时,当木薯淀粉添加量在0.96%~1.12%之间,初始pH在5.56~6.11之间,酶活力显示最大值;木薯淀粉添加量为1%时,当FeCl3·6H2O添加量在0.040 1%~0.053 5%之间,初始pH在5.55~6.10之间,酶活显示最大值。

图11 木薯淀粉、FeCl3·6H2O添加量与初始pH值交互作用对几丁质脱乙酰酶酶活影响的响应曲面与等高线
Fig.11 Response surface plots and contour lines of effects of interaction between cassava starch,FeCl3·6H2O addition and initial pH on chitin deacetylase activity

利用响应面法对发酵工艺条件进行优化,得到最佳培养基组合为:木薯淀粉1.07%、FeCl3·6H2O 0.044 6%、初始pH值5.72,发酵产酶活预测值为4.23 U/mL。为了保证试验的方便可行,将试验条件修正为木薯淀粉添加量1.1%、FeCl3·6H2O添加量0.045%、初始pH 5.7进行验证试验,结果显示,CDA酶活为4.07 U/mL,表明CDA的酶活与理论值非常接近,相对误差<5%,说明该方程拟合度很好,可以用来预测实际结果。

因此,菌株MCDA3-3产CDA的最佳培养基配方为木薯淀粉1.1%、玉米浆1.0%、FeCl3·6H2O 0.045%、陈海水配制,初始pH 5.7。最佳培养条件为:接种量4%、温度30 ℃、180 r/min发酵48 h。通过优化,CDA酶活增加到4.07 U/mL,是优化前的2.3倍。

3 讨论

目前,壳聚糖的生产主要采用化学方法。通过提高碱的浓度、反应温度和延长反应时间可以提高壳聚糖的脱乙酰度。杨俊玲[8]用45%的NaOH溶液与甲壳素混合,在85 ℃水浴锅中加热3 h后水洗至中性,获得的壳聚糖脱乙酰度为84.1%。NEMTSEV S V等[9]以蜂蜜为原料制备甲壳素,将甲壳素置于50%的NaOH溶液中水浴制得产率为16%~25%的壳聚糖。传统的化学法提取壳聚糖存在很多的缺陷:使用了大量的酸碱,消耗能源的同时,环境污染严重[10];壳聚糖的后续纯化过程复杂,增加了生产成本;造成壳聚糖分子量及乙酰化程度的降低,从而影响壳聚糖产品品质。为了解决化学酸碱法带来的问题,酶法生产壳聚糖作为一种新型绿色环保的脱乙酰方法,是利用专一性酶对几丁质进行脱乙酰基处理,反应条件温和,能耗值相对较低,可获得脱乙酰程度均一稳定的产品[11]

SURESH P V等[12]从泥土中分离出产CDA的青霉轮枝菌和尖孢镰刀菌。HAMER S N等[13]研究了菜豆刺盘孢属菌不同底物固态发酵生产CDA。王瑶等[14]从海边红树林虾场土壤中筛选的一株产CDA的放线菌桔橙小单孢菌(Micromonospora aurantiaca)。目前CDA产生菌以丝状真菌居多,有被孢霉属[15]、根霉属[16]、帚霉属[17]等。产CDA的细菌相对较少,有微小杆菌属[18]和红球菌属[19-20]

4 结论

从连云港市海州湾海域筛选获得了一株产几丁质脱乙酰酶细菌MCDA3-3,鉴定为海洋硝酸盐还原菌(Nitratireductor aquimarinus)。优化获得了该菌产CDA最适发酵培养基配方为木薯淀粉1.1%,玉米浆1.0%,FeCl3·6H2O 0.045%,陈海水配制,pH 5.7;最适发酵条件为接种量4%、30 ℃、180 r/min发酵48h。在此条件下培养,菌株酶活达到4.07U/mL,是优化前的2.3倍。

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Screening,identification and enzyme production conditions optimization of chitin deacetylase-producing marine bacteria

CHAI Jinlong1,WANG Minbo1,HANG Jiahao1,ZHANG Chunguang1,CHEN Li2,JIAO Yuliang1,LI Yiyong3,FANG Yaowei1,2,LIU Shu1,2*
(1.College of Marine Life and Fisheries,Jiangsu Ocean University,Lianyungang 222005,China;2.Jiangsu Marine Resources Development Research Institute,Lianyungang 222000,China;3.School of Marine Resources and Environment,Jiangsu Ocean University,Lianyungang 222005,China)

Abstract:The chitin deacetylase-producing bacteria were screened from marine samples,the high yield strain was identified,and the fermentation conditions were optimized by response surface methodology.According to yellow circle on a plate with nitroacetanilide,a chitin deacetylase producing bacterium MCDA3-3 was obtained from marine mud samples in Haizhou bay,and was identified as Nitratireductor aquimarinus by morphological,physiological and biochemical characterizations and 16S rDNA sequence analysis.The enzyme production fermentation medium and fermentation conditions were optimized by single factor and response surface methodology.The optimal fermentation medium was cassava starch 1.1%,corn syrup 1.0%,FeCl3·6H2O 0.045%,aged seawater preparation,pH 5.7.The optimal fermentation condition was inoculum 4%,fermentation temperature 30 ℃,rotating speed 180 r/min,and time 48 h.Under the optimal conditions,the enzyme activity was 4.07 U/ml,which was 2.3 times that before optimization.

Key words:chitin deacetylase;marine bacteria;response surface methodology;fermentation condition optimization

中图分类号:Q93-335

文章编号:0254-5071(2019)10-0089-07

doi:10.11882/j.issn.0254-5071.2019.10.018

引文格式:柴金龙,王敏卜,杭加豪,等.产几丁质脱乙酰酶海洋细菌的筛选鉴定及产酶条件优化[J].中国酿造,2019,38(10):89-95.

收稿日期:2019-05-27

修回日期:2019-08-27

基金项目:国家自然科学基金项目(31772016);江苏省海洋科技创新专项(HY2018-10);江苏省“六大人才高峰”第十三批高层次人才项目(SWYY-195);江苏省“333高层次人才培养工程”;连云港市“521高层次人才培养工程”;江苏省大学生创新创业训练计划项目(SY20191164140100,X201911641401001)

作者简介:柴金龙(1993-),男,硕士研究生,研究方向为海洋微生物技术。

*通讯作者:刘 姝(1975-),女,副教授,博士,研究方向为海洋微生物及其活性物质。