海洋低温肌氨酸氧化酶生产菌株的筛选、鉴定及酶学特性研究

迟乃玉1,2,刘 洋1,2,于 爽1,2,希 伦1,2,李美玉1,2,张庆芳1,2*

(1.大连大学 生命科学与技术学院,辽宁 大连 116622;2.辽宁省海洋微生物工程技术研究中心,辽宁 大连 116622)

摘 要:为获得更适应低温环境的产肌氨酸氧化酶菌株,该研究从渤海海泥中分离、筛选高产低温肌氨酸氧化酶菌株,采用形态观察、生理生化试验及分子生物学技术对其进行鉴定,并对其所产的肌氨酸氧化酶的酶学特性进行初步研究。结果表明,共分离到产肌氨酸氧化酶的菌株8株,其中菌株LYH18的肌氨酸氧化酶活力最高,为1.65 U/mL;菌株LYH18被鉴定为海泥芽孢杆菌(Bacillus oceanisediminis);肌氨酸氧化酶的最适作用温度和pH分别为25℃、8.0,在温度25~40℃、pH 7.0~10.0的范围内,酶活性较稳定,该酶属于低温酶。

关键词:肌氨酸氧化酶;筛选;鉴定;酶学性质

肌氨酸氧化酶(sarcosine oxidase,SOX)属于黄素蛋白氧化酶类,在自然界中分布广泛。其是酶法测定肌酐中研究较多的一种酶,可催化肌氨酸中的N-甲基氧化,可偶联肌酐酶和肌酸酶降解肌酐。作为一种重要的诊断酶制剂,是测定血清或尿液中肌酐含量的关键酶之一,应用于肾脏的健康程度的诊断[1]

为了满足工业用酶的需求,赵更锋等[2-9]已从肌氨酸氧化酶的分布、酶学性质以及分子生物学方面进行了大量研究。SUZUKIM[10]最早发现棒状杆菌属(Corynebacterium sp.)可以产肌氨酸氧化酶,随后相继发现假单胞菌(Pseudomonas)、链霉菌(Streptomyces)、芽孢杆菌(Bacillus)和节杆菌(Arthrobacter)等微生物均可产肌氨酸氧化酶[11-16]。但目前依然存在着许多不足之处,如热稳定性普遍较差,使其在一些领域的应用中受到限制。MORIN等[17]从土壤中筛选出一株产单聚体肌氨酸氧化酶的铵镨柱胞霉菌(Cylindrocarpon didymium)M-1,测得该单聚体肌氨酸氧化酶分子质量为48 kDa,最适pH值为7.5,最适温度为40℃,将该酶在45℃处理10 min,残余酶活力为75%。

本研究从渤海海泥中分离、筛选一株高产低温肌氨酸氧化酶菌株,采用形态观察、生理生化试验及分子生物学技术对其进行鉴定,并对其所产的肌氨酸氧化酶酶学性质进行初步研究,为肾脏疾病诊断试剂盒的研发提供优质的菌种资源。

1 材料与方法

1.1 材料与试剂

1.1.1 样品

海泥样品:辽宁省大连渤海湾(N:39°7′,S:121°41′)。

1.1.2 试剂

肌酸:大连凯美化工工程配套有限公司;脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)纯化试剂盒:大连宝生物有限公司;酵母膏、硫酸镁、磷酸氢二钾、磷酸二氢钾、碘化钾、淀粉、牛肉膏、胰蛋白胨、氯化钠:生工生物工程(上海)股份有限公司;所有试剂均为国产分析纯或生化试剂。

1.1.3 培养基[18]

富集培养基:肌酸5.0 g/L,酵母膏0.5 g/L,硫酸镁0.5 g/L,磷酸氢二钾0.5 g/L,磷酸二氢钾2 g/L,海水1 L,pH 7.0。

分离培养基:肌酸5.0 g/L,酵母膏5 g/L,硫酸镁0.5 g/L,磷酸氢二钾0.5 g/L,磷酸二氢钾2 g/L,碘化钾1.7 g/L,淀粉10 g/L,海水1 L,pH 7.0。

种子培养基:胰蛋白胨10 g/L,牛肉膏5 g/L,NaCl 10 g/L,海水1 L,pH 7.0。

发酵培养基:肌酸5.0 g/L,酵母膏5 g/L,硫酸镁0.5 g/L,磷酸氢二钾0.5 g/L,磷酸二氢钾2 g/L,海水1 L,pH 7.0。

LB培养基:胰蛋白胨10 g/L,酵母提取物5 g/L,氯化钠10 g/L。

以上固体培养基中加入20 g/L琼脂,培养基均在0.1 MPa、121℃条件下高压蒸汽灭菌20 min。

1.2 仪器与设备

HZP-256全温振荡培养箱:上海智诚分析仪器制造有限公司;CX21FS3显微镜:日本OLYMPUS公司;NB-1630超净工作台、UV-H232可见紫外分光光度计:菲迪康乐(广州)科学仪器有限公司;LDFX-50BI立式压力蒸汽灭菌锅:兰州方盛生物科技有限公司;APL-204电子天平、pH-3G pH计:陕西鼎盛仪器设备有限公司;MBS聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)仪:上海普迪生物技术有限公司。

1.3 试验方法

1.3.1 产肌氨酸氧化酶菌株的筛选

菌株初筛:取大连渤海海湾海泥10 g于100 mL富集培养基中,在20℃、150 r/min条件下振荡培养,每天测肌酸含量。待肌酸完全降解后,富集培养液经10倍梯度稀释至10-6,将稀释液涂布于固体分离培养基,25℃条件下倒置培养24 h,挑取变为蓝绿色的菌落进行分离、纯化。将分离得到的菌株接种到新鲜的分离培养基中,20℃、150 r/min条件下培养72 h,测定肌酸的降解情况。

菌株复筛:将可降解肌酸的菌株接种于发酵培养基中,20℃、150 r/min条件下培养48 h,测定其肌氨酸氧化酶活力。

1.3.2 肌酸降解率的测定[19]

在0.5 mL的样品中,加入1 mL含有1%α-萘酚的1.5 mol/L NaOH、0.5 mL 0.05%的双乙酰,显色30 min,再加入3 mL蒸馏水,于波长530 nm处测定吸光度值。计算肌酸降解率,计算公式如下:

1.3.3 肌氨酸氧化酶活力的测定[19]

将待测菌体进行超声破壁后,于4℃、8 000 r/min条件下离心15 min,取上清酶液0.1 mL于0.9 mL含有0.1 mol/L肌氨酸的焦磷酸钠缓冲液(pH 7.4)中,37℃反应10 min,再加入0.25 mL 0.1 mol/L的醋酸终止反应,并加入1.5 mL含有0.04%乙酰丙酮的20%乙酸铵溶液,于37℃反应40 min后,在波长410 nm处测定吸光度值。

肌氨酸氧化酶活力定义:在37℃、pH 7.0条件下每分钟分解1μmol肌氨酸的酶量为一个酶活力单位(U)。

1.3.4 菌株的鉴定

形态观察:将试验菌株划线于固体LB平板上,20℃恒温培养24 h,观察菌株的菌落形态特征,并挑取单菌落,进行革兰氏染色,观察菌株的细胞形态。

生理生化试验[20]:对试验菌株进行V-P反应、接触酶反应、硝酸盐还原试验、产生吲哚试验、淀粉水解试验、明胶水解试验、含碳化合物的利用等试验。

分子生物学鉴定:将试验菌株接种于富集培养基中,20 ℃、150 r/min条件下培养48 h,8 000 r/min离心15 min后弃上清,加入100μL无菌重蒸水(ddH2O)中,混匀,沸水处理10 min,12 000 r/min离心10 min,以上清液为模板对试验菌株的16S rDNA基因序列进行PCR扩增[19]。正向引物为BSF8/20(5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3');反向引物为BSR1541/20(5'-AAGGAGGTGATCCAGCCGCA-3')。采用DNA纯化试剂盒对PCR扩增产物进行纯化,并送至北京诺禾致源生物技术有限责任公司进行测序。将测序结果提交至美国国家生物技术信息中心(national center for biotechnology information,NCBI)的GenBank数据库中,与已知菌种的16S rDNA序列进行BLAST同源性比对,选择若干条同源性较高的模式菌株的16S rDNA序列,采用MEGA 5.0软件中的邻接(neighbor joining,NJ)法构建系统发育树,确定其分类地位。

1.3.5 肌氨酸氧化酶酶学性质的初步研究

最适作用温度:按照肌氨酸氧化酶活力的测定方法,分别在不同作用温度条件下(5~70℃,梯度为5℃),测定肌氨酸氧化酶活力,确定酶的最适反应温度;将同组实验中最高酶活力设为100%,计算相对酶活。

热稳定性:将粗酶液分别在不同温度条件下(25℃、30℃、40℃、50℃、60℃、70℃)处理60 min,测定酶活力。

最适作用pH:分别在不同pH值条件下(4.0~11.0,梯度为0.5)测定肌氨酸氧化酶酶活力,确定酶的最适反应pH。其中pH 4.0~6.0为0.1 mol/L柠檬酸-柠檬酸钠缓冲液;pH 6.0~8.5为0.1 mol/L磷酸盐缓冲液;pH 8.5~9.5为0.05 mol/L硼砂-硼酸缓冲液;pH 9.5~11.0为0.05 mol/L硼砂-NaOH缓冲液。

pH稳定性:将粗酶液分别于不同pH值(4.0~11.0,梯度为0.5)的缓冲液中,37℃保温18 h,测定酶活力。

不同金属离子对肌氨酸氧化酶活性的影响:将粗酶液分别加入含有1 mmol/L或10 mmol/L不同金属离子(Co2+、Ca2+、K+、Fe2+、Zn2+、Mn2+、Mg2+、Ni2+、Cu2+)的溶液中,37 ℃保温30 min,测定酶活力。将未加入金属离子的酶液活力设为100%,计算各组的相对酶活。

2 结果与分析

2.1 产肌氨酸氧化酶菌株的初筛

通过初筛发现,27个菌落周围变成蓝绿色,其中10株菌株(LYH03、LYH09、LYH18、LYH36、LYH44、LYH45、LYH83、LYH106、LYH186、LYH221)可降解肌酸(对照菌株肌酸降解率为4.5%),结果见表1。由表1可知,菌株LYH18降解肌酸的能力最强,培养72 h后,肌酸降解率达75%。

表1 菌株的肌酸降解率
Table 1 Creatine degradation rate of strains

菌株编号 肌酸降解率/% 菌株编号 肌酸降解率/%LYH03 LYH09 LYH18 LYH36 LYH044 54 44 75 58 62 LYH45 LYH83 LYH106 LYH186 LYH221 67 53 66 68 42

2.2 产肌氨酸氧化酶菌株的复筛

将初筛获得的10株菌进行摇瓶发酵,测定其肌氨酸氧化酶活力,结果如表2所示。

表2 菌株产肌氨酸氧化酶的酶活比较
Table 2 Comparison of enzyme activities of sarcosine oxidase produced by strains

菌株编号 LYH03 LYH09 LYH18 LYH36 LYH44 LYH45 LYH83 LYH106 LYH186 LYH221酶活/(U·mL-1)0.15 0.67 1.65 1.02 0.89 1.12 0.85 1.14 1.21 0.18

由表2可知,菌株LYH18的肌氨酸氧化酶活力最高,为1.65 U/mL,与肌酸降解情况一致。因此,选取菌株LYH18为目标菌株,对其进行菌种鉴定。

2.3 菌株的鉴定

2.3.1 形态观察

菌株LYH18的菌落与细胞形态见图1。由图1a可知,菌株LYH18在LB固体培养基上,菌落呈圆形,隆起,表面光滑,湿润,边缘整齐,无色,易挑取;由图1b可知,革兰氏染色呈阳性,在LB固体培养基上生长3 d后形成芽孢,芽孢形状为椭圆形,菌体呈杆状。这些特征表明,菌株LYH18呈现出典型的细菌特征。

图1 菌株LYH18的菌落(a)和细胞(b)形态
Fig.1 Colony(a)and cell(b)morphology of strain LYH18

2.3.2 生理生化鉴定

参照《常见细菌系统鉴定手册》(第8版)[21]对菌株LYH18进行生理生化试验,生理生化特征结果见表3。

由表3可知,菌株LYH18在无氧条件下不能生长,接触酶试验呈阳性,V-P反应呈阴性,对氯化钠有较强的耐受性,在10%NaCI条件下能够生长;不能分解酪酛、明胶及淀粉;可将硝酸盐还原为亚硝酸盐;能利用多种碳水化合物,如D-半乳糖、L(+)-鼠李糖、纤维二糖、葡萄糖、蔗糖、松三糖,但不能利用D-木糖、棉子糖和D-甘露糖;不能产吲哚。结合形态观察,根据《常见细菌系统鉴定手册》(第8版)初步鉴定菌株LYH18为芽孢杆菌属(Bacillus)。

表3 菌株LYH18的生理生化特征
Table 3 Physiological and biochemical characteristics of strain LYH18

注:“+”表示为阳性反应;“-”表示为阴性反应。

项目 结果 项目 结果接触酶V-P反应2%NaCI 5%NaCI 7%NaCI 10%NaCI酪酛水解明胶水解淀粉水解硝酸盐还原+ - + + + + - - - +D-半乳糖L(+)-鼠李糖纤维二糖葡萄糖蔗糖松三糖D-木糖棉子糖D-甘露糖吲哚+ + + + + + - - - -

2.3.3 分子生物学鉴定

为了进一步鉴定分离菌株LYH18,将其16S rDNA序列在GenBank数据库中进行同源性比对。结果表明,菌株LYH18与Bacillus的多个菌种的序列相似性>97%,采用MEGA5.0软件中的NJ法构建系统发育树,结果如图2。由图2可知,菌株LYH18与海泥芽孢杆菌(Bacillus oceanisediminis)H2同源性(99%)较高,亲缘关系最近。结合形态观察及生理生化试验结果,将菌株LYH18鉴定为海泥芽胞杆菌(Bacillus oceanisediminis)。

图2 基于16S rDNA序列菌株LYH18的系统发育树
Fig.2 Phylogenetic tree of strain LYH18 based on 16S rDNA sequences

2.4 酶学性质研究

2.4.1 肌氨酸氧化酶的最适作用温度

不同作用温度条件下测定肌氨酸氧化酶活力,结果见图3。由图3可知,当作用温度在10~15℃时,肌氨酸氧化酶的活性随着作用温度的升高而急剧增大;当作用温度为25℃时,肌氨酸氧化酶活力最高;当作用温度在15~45℃时,相对酶活力基本保持在80%以上,说明在室温条件下,该酶即可保持较高酶活,这一特点可节省能源的消耗;当作用温度高于45℃后,酶活性急剧下降;当作用温度高于50℃后,相对酶活<60%。结果表明,肌氨酸氧化酶的最适作用温度为25℃,该酶对高温条件比较敏感,更适合低温条件。

图3 肌氨酸氧化酶的最适反应温度
Fig.3 Optimal reaction temperature of sarcosine oxidase

2.4.2 肌氨酸氧化酶的热稳定性

肌氨酸氧化酶的热稳定性如图4所示。由图4可知,肌氨酸氧化酶在25~40℃条件下处理60 min后,相对酶活>80%,保持高酶活性,说明该酶在室温条件下,较稳定;当处理温度高于40℃以后,相对酶活力逐渐下降,符合海洋低温酶的特性[23];该酶在50℃处理60 min后,相对酶活力急速下降,仅保留30%的相对酶活力;在60℃、70℃处理60 min,相对酶活力均<10%,说明该酶热稳定性较弱。

图4 肌氨酸氧化酶的热稳定性
Fig.4 Thermal stability of sarcosine oxidase

2.4.3 肌氨酸氧化酶的最适作用pH值

不同作用pH值条件下测定肌氨酸氧化酶活力,结果如图5所示。由图5可知,该肌氨酸氧化酶作用的最适作用pH为8.0,且pH值在7.5~9.0之间时,相对酶活性较高,可保持在80%以上;当pH值≤7.0或≥9.0时,相对酶活性较低。

图5 肌氨酸氧化酶的最适作用pH值
Fig.5 Optimal reaction p H of sarcosine oxidase

2.4.4 肌氨酸氧化酶的pH稳定性

肌氨酸氧化酶的pH稳定性结果如图6所示。由图6可知,该酶在pH值≤6.0时,相对酶活<40%;在pH值7.0~10.0之间时,酶活可保持在80%以上,较稳定;由此可以得出,在中性至弱碱性条件下,肌氨酸氧化酶活性较高,较稳定,说明该酶耐弱碱性。

图6 肌氨酸氧化酶的pH稳定性
Fig.6 pH stability of sarcosine oxidase

2.4.5 不同金属离子对肌氨酸氧化酶活性的影响

不同金属离子对肌氨酸氧化酶活力的影响见图7。

图7 不同金属离子对肌氨酸氧化酶活性的影响
Fig.7 Effect of different metal ions on sarcosine oxidase activity

由图7可知,不同金属离子对酶的作用不同;同种金属离子在不同终浓度条件下对酶的作用也不同。其中Ca2+、Fe2+、Ni2+、Cu2+能使该酶失活,而K+对酶活性几乎没有影响;Co2+、Zn2+、Mg2+对酶活性有一定促进作用,其中Co2+对酶活性促进作用最强。

3 结论

本研究从渤海湾海泥样品中分离到一株高产肌氨酸氧化酶的菌株LYH18,肌氨酸氧化酶活力为1.65 U/mL。通过形态观察、生理生化分析和分子生物学技术鉴定菌株LYH18为海泥芽胞杆菌(Bacillus oceanisediminis)。经初步探索其产肌氨酸氧化酶的酶学性质,结果表明,该菌株所产的肌氨酸氧化酶的最适作用温度和pH值分别为25℃和8.0,在温度25~40℃和pH 7.0~10.0范围内,酶活性较稳定,该酶属于低温酶类。菌株LYH18作为一株产肌氨酸氧化酶的新菌源,具有潜在的开发价值。

参考文献:

[1]贾国辉,王耀荣.酶法肌酐检测的方法学改进探讨[J].中国冶金工业杂志,2015,32(3):369-270.

[2]赵更锋,马晓航.产肌氨酸氧化酶菌株的分离及发酵条件研究[J].微生物学报,2003,42(2):235-240.

[3]侯赣生.肌酐检测工具酶的高效表达及其酶学性质分析[D].广州:华南理工大学,2017.

[4]SUZUKI K,OGISHIMA M,SUGIYAMA M,et al.Molecular cloning and expression of a Streptomyces sarcosine oxidase gene in Streptomyces lividans[J].Biosci Biotech Bioch,1992,56(3):432-436.

[5]INOUYE Y,NISHIMURA M,MATSUDA Y,et al.Purification and characterization of sarcosine oxidase of Streptomyces origin[J].Chem Pharm Bull,1987,35(10):4194-4202.

[6]MATSUDA Y,HOSHIKA H,INOUYE Y,et al.Purification and characterization of sarcosine oxidase of Bacillus origin[J].Chem Pharm Bull,1987,35(2):711-717.

[7]NISHIYA Y,IMANAKA T.Cloning and sequencing of the sarcosine oxidase gene from Arthrobacter sp.TE1826[J].J Ferment Bioeng,1993,75(4):239-244.

[8]HASSAN-ABDALLAH A,ZHAO G H,ESCHENBRENNER M,et al.Cloning,expression and crystallization of heterotetrameric sarcosine oxidase from Pseudomonas maltophilia[J].Protein Expres Purif,2005,43(1):33-43.

[9]LEE S,JIA B,PHAM P,et al.Architecture and characterization of sarcosine oxidase from Thermococcus kodakarensis KOD1[J].Extremophiles,2012,16(1):87-93.

[10]SUZUKIM.Purification and some properties of sarcosine oxidase from Corynebacterium sp.U-96[J].J Biochem,1981,89(2):599-607.

[11]刘辉,孙桂琴,马晓航,等.芽胞杆菌BSD-8肌氨酸氧化酶的纯化与性质[J].生物工程学报,2010,26(3):335-340.

[12]KAPLAN A,NAUGLAR D.Creatinine hydrolase and creatine amidinohydrolase:I.Presence in cell-free extracts of Arthrobacter ureafaciens[J].Mol Cell Biochem,1974,3(1):9-15.

[13]IDA K,MORIGUCHIT,SUZUKIH.Crystal structure of heterotetrameric sarcosine oxidase from Corynebacterium sp.U-96[J].Biochem Bioph Res Co,2005,333(2):359-366.

[14]NAGATA K,SASAKIH,HUA M,et al.Crystal structure of monomeric sarcosine oxidase from Bacillus sp.NS-129 reveals multiple conformations at the active-site loop[J].P Jpn Acad B-Phys,2005,81(6):220-224.

[15]KIM J M,SHIMIZU S,YAMADA H.Sarcosine oxidase involved in creatinine degradation in Alcaligenes denitrificans subsp.denitrificans J9 and Arthrobacter sp.J5 and J11[J].J Agr Chem Soc Jpn,1986,50(11):2811-2816.

[16]KIM J M,SHIMIZU S,YAMADA H.Crystallization and characterization of sarcosine oxidase from Alcaligenes denitrificans subsp.denitrificans[J].Agr Biol Chem,1987,51(4):1167-1168.

[17]MORIN,KAWAKAMIB,HYAKUTOME K,et al.Characterization of betaine aldehyde dehydrogenase from Cylindrocarpon didymum M-1[J].J Agr Chem Soc Jpn,1980,44(12):3015-3016.

[18]郭康平.Bacillus sp.BSD-8肌酐降解酶系的研究[D].杭州:浙江大学,2008.

[19]孙桂芹.Bacillus sp.BSD-8肌氨酸氧化酶的研究[D].杭州:浙江大学,2004.

[20]任楠楠,迟乃玉,张庆芳.海洋低温甾醇酯酶菌株的筛选鉴定及其酶学特性研究[J].中国酿造,2019,38(1):37-41.

[21]东秀珠,蔡妙英.常见细菌系统鉴定手册[M].北京:科学出版社,2001:43-65.

Screening,identification and enzymatic characteristics of marine low-temperature sarcosine oxidase producing strain

CHINaiyu1,2,LIU Yang1,2,YU Shuang1,2,XILun1,2,LIMeiyu1,2,ZHANG Qingfang1,2*
(1.College of Life Science and Biotechnology,Dalian University,Dalian 116622,China;2.Liaoning Marine Microbial Engineering and Technology Center,Dalian 116622,China)

Abstract:In order to obtain sarcosine oxidase producing strain adapted to low-temperature environment,a high yield low-temperature sarcosine oxidase strain was isolated and screened from Bohai Sea mud,identified by morphological observation,physiological and biochemical tests and molecular biological techniques,and the enzymatic characteristics of sarcosine oxidase were preliminarily studied.The results showed that 8 sarcosine oxidase producing strainswere isolated.Among them,the sarcosine oxidase activity of strain LYH18 was the highest(1.65 U/ml).The strain LYH18 was identified as Bacillus oceanisediminis.The optimum temperature and pH of the sarcosine oxidase were 25℃and 8.0,respectively.The enzyme activity was stable in the range of temperature 25-40℃and pH 7.0-10.0,and the enzyme belonged to low temperature enzyme.

Key words:sarcosine oxidase;screening;identification;enzymatic property

中图分类号:Q93

文章编号:0254-5071(2019)06-0030-05 doi:10.11882/j.issn.0254-5071.2019.06.006

引文格式:迟乃玉,刘洋,于爽,等.海洋低温肌氨酸氧化酶生产菌株的筛选、鉴定及酶学特性研究[J].中国酿造,2019,38(6):30-34.

收稿日期:2019-03-27 修回日期:2019-04-09

基金项目:国家高技术研究发展计划‘863计划’(No.2018YFC0311100);国家自然科学基金(No.31500039);辽宁省自然科学基金项目(No.20170520167,20180550728);大连市支持高层次人才创新创业项目(No.2017RQ155)

作者简介:迟乃玉(1965-),男,教授,博士,研究方向为微生物工程的基础理论及应用技术研究。

*通讯作者:张庆芳(1965-),女,教授,博士,研究方向为微生物工程的基础理论及应用技术研究。